H εξάρτηση από ουσίες επιβαρύνει σοβαρά τόσο τη σωματική όσο και την ψυχική υγεία. Η φροντίδα της υγείας αποτελεί βασικό μέλημα του ΚΕΘΕΑ από την πρώτη στιγμή που οι χρήστες ναρκωτικών θα προσεγγίσουν τα προγράμματά του. Για το λόγο αυτό έχει δημιουργήσει στην Αθήνα το Ψυχοδιαγνωστικό Κέντρο με στόχο την έγκαιρη διάγνωση και αποτελεσματική αντιμετώπιση των προβλημάτων υγείας των μελών του.



Το Κέντρο στελεχώνεται από εξειδικευμένο ιατρικό και νοσηλευτικό προσωπικό (ψυχιάτρους, παιδοψυχίατρο, παθολόγο, νοσηλευτές, οδοντίατρο). Παρέχει υπηρεσίες οι οποίες αφορούν την πρωτοβάθμια περίθαλψη γενικής ιατρικής-παθολογίας, παιδοψυχιατρικής, ψυχιατρικής και οδοντιατρικής, καθώς και υπηρεσίες πρόληψης όλων των βαθμίδων στους παραπάνω τομείς. Επιπλέον, σε όλες τις μεγάλες πόλεις όπου λειτουργούν υπηρεσίες του ΚΕΘΕΑ ο οργανισμός έχει αναπτύξει δίκτυα συνεργασίας με νοσοκομεία και άλλες δημόσιες υπηρεσίες υγείας.